如果您正在籌建一個男科醫院，需要申辦醫療機構執業許可證，以下是具體的流程：

1. 準備材料。準備所需的各種證明材料，包括醫療機構法人營業執照、衛生許可證、醫療器械經營許可證、藥品生產（經營）許可證等文件。

2. 提交申請。填寫醫療機構執業許可證申請表，以及搜集好的相關證明材料，遞交至所在地衛生行政部門。

3. 現場核查。衛生行政部門會派出工作人員對醫療機構的相關材料進行現場審核和檢查，需要檢查的內容包括醫院的基礎設施、醫療設備、醫療團隊、衛生管理等方面。

4. 報批。審核通過之后，衛生行政部門會將審核結果提交至上級衛生行政部門進行審批。

5. 領證。頒發醫療機構執業許可證，醫療機構執業許可證的有效期為三年。

需要注意的是，申請醫療機構執業許可證的過程較為復雜，需要仔細了解和嚴格執行衛生行政部門的規章制度，確保手續齊備、資格符合要求，才能順利申請到醫療機構執業許可證。